L'Ajuntament de Figueres ha participat en el projecte InnWater finançat per la Unió Europea en el marc del programa Horizon Investigació i Innovació 2021-2027. El projecte s'ha desenvolupat durant 3 anys, amb inici el dia 1 de març de 2023 i finalització el 28 de febrer de 2026. L'objectiu del projecte ha estat dissenyar i assajar instruments per a una millor governança de l'aigua en ciutats i territoris amb problemàtiques particulars de gestió de l'aigua. En el cas de Figueres s'ha centrat en la gestió de l'aigua a la conca de la Muga en un context de sequera i escassetat d'aigua. 

El projecte s'ha basat en la definició i els principis que la OCDE (Organització per la Cooperació i el Desenvolupament Econòmica) estableix sobre la governança de l'aigua. Durant els tres anys, s'han organitzat 7 seminaris de debat. Hi han participat un total de 47 persones en representació dels principals actors territorials implicats en la gestió de l'aigua a la conca de la Muga, com ara representants dels municipis tant a nivell polític (alcaldes i regidors) com tècnic (enginyers, ambientòlegs, biòlegs), de les empreses de subministrament d'aigua, de les universitats (Universitat de Girona i Universitat de Barcelona) i centres de recerca, dels agricultors i les comunitats de regants, de les entitats ecologistes locals (IAEDEN), d'un consorci de municipis de la capçalera de la conca (Consorci Salines-Bassegoda), d'un expert en aigua i gestió de comunitats d'usuaris de l'aigua, del Consell Comarcal de l'Alt Empordà, del Parc Natural dels Aiguamolls de l'Empordà,  del sector turístic i de la Fundació Pioneers of Our Time, una fundació privada que duu a terme projectes de custòdia i conservació fluvial al riu Muga.

El seminaris han abordat els principals aspectes del subministrament d'aigua i de la conservació i preservació dels ecosistemes fluvials des de l'òptica dels diferents sectors.